Les chercheurs ont utilisé un agent fabriqué par la société de fournitures de laboratoire Bio-Rad appelé « Résine Chelex 100 » pour préserver l'ARN du SARS-CoV-2 dans des échantillons pour la détection par RT-qPCR. (Photo d'archives)
Des scientifiques des National Institutes of Health (NIH) des États-Unis ont développé une nouvelle méthode de préparation d'échantillons pour détecter le SRAS-CoV-2. La méthode contourne l'extraction du matériel d'ARN génétique du virus, ce qui réduit potentiellement la durée et le coût des tests.
La méthode est le résultat d'une collaboration entre des chercheurs du US National Eye Institute (NEI), du NIH Clinical Center (CC) et du National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIDCR).
Tests standard impliquent l'amplification de l'ARN viral à des niveaux détectables à l'aide d'une technique appelée RT-qPCR. Mais d'abord, l'ARN doit être extrait de l'échantillon. Les fabricants de kits d'extraction d'ARN ont eu du mal à répondre à la demande pendant la pandémie.
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Les chercheurs ont utilisé un agent fabriqué par la société de fournitures de laboratoire Bio-Rad appelé « résine Chelex 100 » pour préserver l'ARN du SRAS-CoV-2 dans des échantillons pour la détection par RT-qPCR.
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« Nous avons utilisé des échantillons de nasopharynx et de salive avec différentes concentrations de virions pour évaluer s'ils pouvaient être utilisés pour la détection directe d'ARN. La réponse était oui, avec une sensibilité nettement élevée. En outre, cette préparation a inactivé le virus, ce qui permet au personnel de laboratoire de manipuler des échantillons positifs en toute sécurité », a déclaré le NIH citant l'auteur principal Bin Guan, de l'US National Eye Institute. L'article a été publié dans iScience.
L'équipe a fait sa découverte en testant une variété de produits chimiques à l'aide d'échantillons synthétiques et humains pour identifier ceux qui pourraient préserver l'ARN dans des échantillons avec une dégradation minimale tout en permettant la détection directe du virus par RT-qPCR.
Pour valider le test, ils ont collecté des échantillons de patients et les ont stockés soit dans un milieu de transport viral, soit dans le tampon de résine chélatante nouvellement développé au NIH Symptomatique Testing Facility.
Les échantillons dans les milieux de transport viral ont été testés par l'équipe de test Covid-19 au centre clinique du NIH, à l'aide d'une extraction d'ARN conventionnelle et de tests RT-qPCR. Les échantillons dans le tampon de résine chélatante ont été chauffés et l'ARN viral a ensuite été testé par RT-qPCR. La nouvelle préparation a considérablement augmenté le rendement d'ARN disponible pour les tests, par rapport à la méthode standard.
— Source : NIH (États-Unis)
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