Die Forscher verwendeten ein Mittel namens “Chelex 100 Resin” des Laborzulieferunternehmens Bio-Rad, um SARS-CoV-2-RNA in Proben für den Nachweis durch RT-qPCR zu konservieren. (Dateifoto)
Wissenschaftler der US-amerikanischen National Institutes of Health (NIH) haben eine neue Methode zur Probenvorbereitung zum Nachweis von SARS-CoV-2 entwickelt. Die Methode umgeht die Extraktion des genetischen RNA-Materials des Virus, wodurch möglicherweise Testzeit und -kosten reduziert werden.
Die Methode ist das Ergebnis einer Zusammenarbeit von Forschern des US-amerikanischen National Eye Institute (NEI), des NIH Clinical Center (CC) und des National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIDCR).
Standardtests beinhalten die Amplifikation viraler RNA auf nachweisbare Niveaus unter Verwendung einer Technik namens RT-qPCR. Aber zuerst muss die RNA aus der Probe extrahiert werden. Hersteller von RNA-Extraktionskits hatten während der Pandemie Schwierigkeiten, mit der Nachfrage Schritt zu halten.
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Die Forscher verwendeten einen Wirkstoff namens „Chelex 100 Resin“, der von der Laborversorgungsfirma Bio-Rad hergestellt wurde, um SARS-CoV-2-RNA in Proben für den Nachweis durch RT-qPCR zu konservieren.
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„Wir haben Nasopharynx- und Speichelproben mit verschiedenen Virionenkonzentrationen verwendet, um zu prüfen, ob sie für den direkten RNA-Nachweis verwendet werden können. Die Antwort war ja, mit ausgesprochen hoher Sensibilität. Außerdem inaktivierte dieses Präparat das Virus, wodurch es für das Laborpersonal sicherer wurde, positive Proben zu handhaben“, zitierte das NIH den Hauptautor Bin Guan vom US-amerikanischen National Eye Institute. Das Papier wurde in iScience veröffentlicht.
Das Team machte seine Entdeckung, indem es eine Vielzahl von Chemikalien mit synthetischen und menschlichen Proben testete, um diejenigen zu identifizieren, die die RNA in Proben mit minimalem Abbau konservieren und gleichzeitig den direkten Nachweis des Virus durch RT-qPCR ermöglichen.
Zur Validierung Nach dem Test sammelten sie Patientenproben und lagerten sie entweder in viralen Transportmedien oder dem neu entwickelten Chelat-Harz-Puffer in der NIH Symptomatic Testing Facility.
Die Proben in viralen Transportmedien wurden vom Covid-19-Testteam im Clinical Center des NIH mit konventioneller RNA-Extraktion und RT-qPCR-Tests getestet. Die Proben im Chelat-Harz-Puffer wurden erhitzt und die virale RNA wurde dann durch RT-qPCR getestet. Das neue Präparat erhöhte die zum Testen verfügbare RNA-Ausbeute im Vergleich zur Standardmethode deutlich.
— Quelle: NIH (US)
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