Lancering van draagbaar RT-PCR-testlaboratorium in samenwerking met Municipal Corporation of Greater Mumbai in Bandra Kurla Complex. (Express File Photo door Amit Chakravarty)
Geschreven door Ruta Patwardhan en Rohini Kelkar
De tweede golf van de Covid-19-pandemie lijkt af te nemen. Maar veel kwesties die in de afgelopen twee maanden aan de orde zijn gesteld, blijven relevant. Maharashtra was opnieuw de zwaarst getroffen staat, waarbij Pune en Mumbai een sterke toename zagen in zowel het aantal gevallen als het aantal mensen dat stierf als gevolg van het virus.
De regering van Maharashtra merkte op dat enkele laboratoria in de staat willekeurig een Ct-waarde van 24 gebruikten als afkapwaarde, wat betekende dat Ct-waarden van 25 en hoger als Covid-19-negatief werden gerapporteerd. De deelstaatregering vroeg de Indian Council of Medical Research (ICMR) om opheldering over wat een acceptabele Ct-waarde zou zijn om een patiënt als negatief te verklaren.
https://images.indianexpress.com/2020/08/1×1.png
Om een Ct-waarde te begrijpen, moeten we weten hoe een RT-PCR-test werkt. De test versterkt of verhoogt de hoeveelheid viraal genetisch materiaal die in het monster aanwezig is, zodat het kan worden gedetecteerd door het RT-PCR-instrument. Laten we, om het heel simpel te zeggen, aannemen dat er één kopie van viraal genetisch materiaal in een monster aanwezig is. Deze kopie wordt twee kopieën in de eerste cyclus van de RT-PCR-test; twee exemplaren worden vier exemplaren in de tweede cyclus. Dit gaat door met het aantal kopieën dat exponentieel toeneemt tijdens elke cyclus, totdat het aantal gegenereerde kopieën het detectieniveau bereikt.
De Ct-waarde of de cyclusdrempelwaarde is het cyclusnummer waarbij het virale genetische materiaal voldoende is versterkt om door het instrument te worden gedetecteerd. Als bijvoorbeeld het virale genetische materiaal wordt gedetecteerd na 10 cycli, is de Ct-waarde 10.
Het is dan redelijk dat als het monster al veel virale deeltjes bevat, minder cycli voldoende zijn om het detectieniveau bereiken. Omgekeerd, als het monster maar een paar virale deeltjes bevat, zijn vele cycli nodig totdat een detecteerbaar aantal virale deeltjes is gegenereerd.
Daarom, hoe hoger de viral load, minder de Ct-waarde en minder de viral load, hoe hoger de Ct-waarde.
Ct-waardelimiet voor het beschouwen van een patiënt als positief varieert van kit tot kit en wordt over het algemeen gegeven door de fabrikant van de kit na validatie. Zoals bij elke andere test, is het raadzaam om de richtlijnen van de fabrikant te volgen tijdens het uitvoeren en interpreteren van een test. Voor de meeste RT-PCR-kits die momenteel beschikbaar zijn, wordt een Ct-waarde van 35 beschouwd als de grenswaarde.
Dus, komt een lagere Ct-waarde overeen met slechtere patiëntuitkomsten? Het is belangrijk om te weten dat de Ct-waarde afhankelijk is van een groot aantal factoren, zoals hoe goed het monster is verzameld, hoe snel het is vervoerd, hoe snel het is getest, hoe het is bewaard tot het moment van testen, de kit en het gebruikte instrument, en zelfs het stadium van de infectie waarin het monster werd verzameld. Ct-waarde kan veel variatie vertonen, zelfs bij monsters die op dezelfde dag zijn verzameld. Daarom kan de Ct-waarde van het ene monster niet met het andere worden vergeleken.
Hoewel sommige onderzoeken hebben aangetoond dat lagere Ct-waarden geassocieerd waren met de ergste vormen van de ziekte, hebben we hier geen sluitend bewijs voor. . Gezien de talloze factoren die de Ct-waarde kunnen beïnvloeden, is het voor de behandeling van een patiënt nooit aan te raden om alleen op de Ct-waarde te vertrouwen.
Laten we teruggaan naar de brief van de regering van Maharashtra aan ICMR. Het zocht opheldering over de lagere detectiedrempel die door sommige laboratoria werd gebruikt.
ICMR's antwoord op de vraag die werd geadviseerd over het volgen van de algemeen aanvaarde Ct-waarde voor detectie van positieven, die een Ct van 35 is. Het gebruik van een lagere drempel voor detectie zou betekenen dat een groot aantal patiënten met Ct-waarden tussen 25 en 35 ten onrechte in aanmerking zou worden genomen negatief. Deze patiënten, vooral degenen die geen symptomen hebben, kunnen de infectie echter blijven verspreiden.
Wat betekent dat vanuit het perspectief van de patiënt? Bij een pandemie moet de ontwikkeling van symptomen patiënten ertoe aanzetten alle voorzorgsmaatregelen te nemen, zonder te wachten op testresultaten. Zelfs als het testrapport negatief is, maar patiënten symptomen vertonen, moeten ze zichzelf in quarantaine plaatsen.
Elke positieve melding, ongeacht de Ct-waarde, dient uiterst serieus te worden behandeld. Patiënten mogen niet in slaap gesust worden met een vals gevoel van veiligheid als de Ct-waarde hoger is dan 25. Ze moeten hun symptomen nauwlettend in de gaten houden en het advies van hun behandelend arts opvolgen.
Patwardhan is consultant microbioloog, Metropolis Healthcare en Kelkar, consultant , klinisch microbioloog en specialist, Metropolis Healthcare, Mumbai
- De website van Indian Express is GROEN beoordeeld vanwege zijn geloofwaardigheid en betrouwbaarheid door Newsguard, een wereldwijde service die nieuwsbronnen beoordeelt op hun journalistieke normen.
© IE Online Media Services Pvt Ltd