Une équipe multi-institutionnelle suit le virus à l’origine de la maladie cutanée nodulaire du bétail en Inde

Une équipe multi-institutionnelle a fourni des informations essentielles sur l'évolution et les origines des souches virales qui alimentent l'épidémie de maladie cutanée nodulaire chez les bovins, a déclaré l'Institut indien des sciences (IISc).

En mai 2022, le bétail à travers l'Inde a commencé à mourir d'une maladie mystérieuse.

Depuis lors, environ 1 00 000 vaches ont perdu leur vie à une épidémie dévastatrice de ce que les scientifiques ont identifié comme une maladie de la peau nodulaire, a déclaré mardi l'IISc, basé à Bangalore, dans un communiqué de presse.

“C'était une calamité à certains égards, une urgence nationale”, a-t-il déclaré. a déclaré Utpal Tatu, professeur au Département de biochimie de l'IISc.

Tatu fait partie d'une équipe multi-institutionnelle qui a décidé de sonder la cause de l'épidémie. Leur étude a été publiée dans « BMC Genomics », indique le communiqué de presse publié par l'IISc.

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Infection virale causée par le virus de la maladie de la peau nodulaire (LSDV), elle est transmise par des insectes comme les mouches et les moustiques. Il provoque de la fièvre et des nodules cutanés et peut être mortel pour le bétail.

Le LSDV a été découvert pour la première fois en Zambie en 1931 et est resté confiné à la région subafricaine jusqu'en 1989, après quoi il a commencé à se propager au Moyen-Orient. , la Russie et d'autres pays d'Europe du Sud-Est, avant de s'étendre à l'Asie du Sud.

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Il y a eu deux épidémies majeures de cette maladie en Inde, la première en 2019 et une épidémie plus grave en 2022, infectant plus de deux millions de vaches, indique le communiqué.

Pour enquêter sur l'épidémie actuelle, l'équipe ils ont collecté des nodules cutanés, du sang et des prélèvements nasaux sur des bovins infectés dans divers États, dont le Gujarat, le Maharashtra, le Rajasthan et le Karnataka, en collaboration avec des instituts vétérinaires.

Ils ont effectué un séquençage avancé du génome entier de l'ADN extrait de 22 échantillons.

« Le plus grand défi était l’absence d’un pipeline établi de séquençage et d’analyse du génome du LSDV. Nous avons dû adapter les techniques de la recherche sur le COVID-19 », a déclaré Ankeet Kumar, doctorant à l'IISc et co-auteur principal.

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“Les données étaient également limitées, nous avons donc compilé toutes les séquences mondiales disponibles du génome du LSDV pour rendre notre analyse robuste,” il a ajouté.

Leur analyse génomique a révélé deux variantes distinctes du LSDV circulant en Inde : un avec un faible nombre de variations génétiques et un autre avec un nombre élevé de variations génétiques. La séquence avec moins de variations était génétiquement similaire aux souches Ranchi 2019 et Hyderabad 2020 qui avaient été séquencées précédemment.

Les échantillons présentant des variations élevées se sont toutefois révélés similaires aux souches de LSDV provenant d'une épidémie en Russie en 2019. 2015.

Kumar a déclaré qu'il n'y avait aucun rapport antérieur faisant état de souches de LSDV aussi variées en Inde. Les virus qui ont de l'ADN comme matériel génétique, comme le LSDV, sont généralement plus stables que les virus à ARN.

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Par conséquent, trouver autant de variations génétiques était assez surprenant et pourrait expliquer la gravité de la maladie, a-t-il ajouté. L'équipe a trouvé un grand nombre de variations génétiques – plus de 1 800. Ceux-ci incluent des délétions et des insertions dans divers gènes, des modifications d'une seule lettre dans l'ADN (appelées SNP) et des variations génétiques dans les régions entre les gènes, indique le communiqué.

Surtout, ils ont découvert un grand nombre de variations génétiques dans les gènes viraux, essentiels à la liaison aux cellules hôtes, à l’évasion de la réponse immunitaire et à la réplication efficace. Cela a probablement accru la capacité du virus à provoquer des maladies.

“Les bovins ont développé des symptômes plus graves dans les zones où nous avons trouvé des souches très diverses. Cela suggère que les variations génétiques pourraient augmenter la virulence,” dit Kumar.

De telles connaissances peuvent ouvrir la voie à de meilleurs diagnostics, vaccins et interventions pour lutter contre les maladies infectieuses émergentes qui menacent le bétail et les moyens de subsistance. Le groupe de recherche de Tatu a mené des études similaires sur le COVID-19 pendant la pandémie, et plus récemment sur le virus de la rage.

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“Les données génomiques s'avéreront inestimables pour le développement d'un vaccin en révélant points chauds moléculaires et variations génétiques à cibler,” a noté Tatu.

“Il s'agit d'une première pour caractériser le paysage génomique du LSDV lors de l'épidémie en Inde à l'échelle nationale.” L'étude représente un exemple du programme « One Health ». approche dans laquelle des équipes multidisciplinaires, comprenant des biologistes moléculaires, des experts en informatique et des médecins vétérinaires, se réunissent pour aborder des questions d'importance nationale.

Tatu souligne également à quel point la collaboration entre les experts vétérinaires et plusieurs institutions scientifiques était essentielle pour retracer les variantes à travers le pays. le pays. « Nous avons beaucoup appris des médecins vétérinaires », a-t-il déclaré. dit-il.

“Ils comprennent leurs connaissances sur le terrain et leur perception de la maladie était très importante pour nous,” il a ajouté.