Un travailleur de la santé prélève un échantillon d'écouvillon d'un cadet du NCC pour le test Covid-19, le premier jour d'un camp de 10 jours du NCC à Nagrota, à la périphérie de Jammu, mercredi 1 mai 18, 2022. (Photo PTI)
Le Centre européen de contrôle et de prévention des maladies a déclaré les sous-variantes BA.4 et BA.5 d'Omicron comme “variantes préoccupantes”. Étant une sous-variante d'Omicron, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) considère déjà les deux comme des “variantes préoccupantes”.
En quoi ces deux sous-variantes d'Omicron sont-elles différentes de celles signalées précédemment – BA.1 et BA.2 – qui ont provoqué la troisième vague en Inde en janvier ? Les deux nouvelles sous-variantes peuvent-elles conduire à une nouvelle vague de Covid-19 dans le pays ? Les infections antérieures et les niveaux élevés de vaccination peuvent-ils protéger contre les maladies graves et les hospitalisations ?
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L'Indian Express examine ce que nous savons des sous-variantes BA.4 et BA.5 d'Omicron jusqu'à présent :
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En quoi les deux nouvelles sous-variantes d'Omicron sont-elles différentes de celles qui ont provoqué la troisième vague de Covid-19 en Inde ?
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Premièrement, les nouvelles sous-variantes ne sont pas si nouvelles. Ils ont été identifiés pour la première fois en Afrique du Sud en janvier de cette année, alors que l'Inde était témoin de la troisième vague de Covid-19. Au cours des quatre mois suivants, BA.4 et BA.5 sont devenus les variantes dominantes en circulation dans ce pays – remplaçant collectivement 55 % des autres variantes de Covid-19, selon l'Institut national des maladies transmissibles d'Afrique du Sud.
Les deux sous-variantes ont depuis été détectées dans plusieurs pays européens et aux États-Unis. Le CDC européen a déclaré les deux “variantes préoccupantes”, anticipant “une augmentation globale significative des cas de Covid-19 dans les semaines et les mois à venir”.
Ce qui préoccupait le plus les scientifiques étaient deux mutations que les deux sous-variantes portaient sur leur domaine de liaison au récepteur – la partie de la pointe du virus qui se fixe aux cellules humaines et pénètre dans le corps.
La mutation F486V, selon des études de laboratoire antérieures, est l'une des plus grandes mutations d'échappement pour les autres sous-variantes d'Omicron, ce qui signifie qu'elle rend le virus plus apte à échapper aux anticorps d'une infection ou d'une vaccination antérieure.
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Le Dr Anurag Agarwal, ancien chef de l'INSACOG et président du groupe consultatif technique de l'OMS sur l'évolution des virus, a déclaré dans un tweet : “Antigéniquement – ; assez différent de BA.1, donc la protection croisée humorale diminuera. (Les anticorps seront moins efficaces).”
Ceci, associé à la diminution de l'immunité des vaccins, est susceptible de conduire à la propagation des deux sous-variantes, a déclaré le CDC européen.
L'autre mutation L452R, qui a été précédemment trouvée dans la variante Delta, est connue pour améliorer la capacité du virus à pénétrer dans les cellules humaines. Une étude en laboratoire menée en Chine montre également que les variants d'Omicron porteurs des mutations L452R sont mieux à même d'infecter les cellules pulmonaires chez la souris. La variante Omicron a entraîné une maladie moins grave dans la plupart des endroits, y compris en Inde, car elle affectait principalement les voies respiratoires supérieures, contrairement à Delta qui affectait gravement les poumons, entraînant une augmentation des hospitalisations, des besoins en oxygène et des décès.
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Les deux sous-variantes sont-elles susceptibles de provoquer des maladies plus graves, des hospitalisations ?
La bonne nouvelle, cependant, est que sur le terrain, BA.4 et BA.5 ne semblent pas entraîner une augmentation des hospitalisations et des décès en Afrique du Sud. “La vague d'infections en Afrique du Sud a culminé avec, jusqu'à présent, peu d'hospitalisations et de décès”, a déclaré le directeur du Center for Epidemic Response and Innovation-South Africa Tulio de Oliveria dans un tweet. Il est également membre du groupe OMS de suivi de l'évolution du Covid-19. Il a ajouté : “Il est intéressant de noter que, jusqu'à présent, dans les pays où la vague de BA.2 est importante, les BA.4 et BA.5 semblent augmenter lentement.”
BA.2 était la sous-variante dominante en Inde lors de la troisième vague. En fait, une analyse de la base de données mondiale des séquences du génome de Covid-19 montre que BA.2 représentait 62 % des séquences de l'Inde au cours des deux derniers mois.
Le CDC européen a également déclaré : ” Il n'y a actuellement aucune indication de changement de gravité pour BA.4/BA.5 par rapport aux lignées précédentes d'Omicron. »
Le Dr Sudhanshu Vrati, l'actuel chef du consortium indien de séquençage génomique INSACOG, est d'accord.
Alors, les variantes sont-elles susceptibles de provoquer une nouvelle augmentation des cas en Inde ?
Le Dr Vrati a déclaré : « Nous avons déjà une expérience de quatre mois dans d'autres pays sur les deux sous-variantes ; la préoccupation initiale était due à la mutation L452 observée dans la variante Delta. Cependant, jusqu'à présent, il n'y a pas eu de corrélation entre ceux-ci et une augmentation de la gravité de la maladie, des hospitalisations ou des décès. Et c'est probablement aussi le cas en Inde.”
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En ce qui concerne l'augmentation du nombre de cas – comme on l'a vu lors de la vague de janvier de la variante Omicron lorsque les cas ont augmenté mais les hospitalisations n'ont pas augmenté proportionnellement – a-t-il déclaré: «Une proportion importante de notre population a eu l'infection et a été vaccinée. Il est peu probable que les sous-variantes causent des ravages. Quant à l'augmentation du nombre de cas, nous avons vu que même maintenant avec la variante standard d'Omicron à Delhi-NCR, le virus trouvera toujours ceux qui ont une immunité plus faible. »
Il a ajouté qu'il n'était pas nécessaire pour que les gens s'inquiètent, mais que le séquençage génomique doit continuer à surveiller les nouvelles variantes qui pourraient entraîner davantage de cas ou une maladie grave.