Expliqué : Quelle est la valeur CT dans le test Covid-19, pourquoi est-ce important ?

0
188

Sur cette photo, un test RT-PCR Covid est en cours dans un hôpital rural près de Barasat dans le district de North 24 Parganas au Bengale occidental. (Photo express de Shashi Ghosh)

Parmi divers termes scientifiques que la pandémie de Covid-19 a fait partie du vocabulaire public, l'un est la “valeur Ct” dans les tests RT-PCR pour déterminer si un patient est positif pour Covid- 19.

Cela a fait l'objet d'une récente demande envoyée par le gouvernement du Maharashtra au Conseil indien de la recherche médicale (ICMR). L'État a cherché à savoir s'il était conseillé de traiter une personne comme Covid-negative si la valeur Ct est supérieure à 24 et que la personne est asymptomatique.

Les responsables de l'État ont déclaré que divers documents de l'ICMR avaient mentionné différentes valeurs de Ct et qu'il y avait des opinions divergentes même entre Niti Aayog et le Centre national de contrôle des maladies.

https://images.indianexpress.com/2020/08/1×1.png < p> Quelques jours plus tard, le DG de l'ICMR a répondu au secrétaire d'État à la Santé que l'ICMR avait recueilli les contributions des laboratoires de virologie de tout le pays pour arriver à un seuil de valeur Ct unique. Tous les patients avec une valeur Ct inférieure à 35 peuvent être considérés comme positifs tandis que ceux avec une valeur Ct supérieure à 35 peuvent être considérés comme négatifs, a déclaré l'ICMR.

Mais qu'est-ce que la valeur Ct ?

Abréviation de seuil de cycle, Ct est une valeur qui ressort lors des tests RT-PCR, l'étalon-or pour la détection du coronavirus SARS-CoV-2. Dans un test RT-PCR, l'ARN est extrait de l'écouvillon prélevé sur le patient. Il est ensuite converti en ADN, qui est ensuite amplifié. L'amplification fait référence au processus de création de multiples copies du matériel génétique – dans ce cas, l'ADN. Cela améliore la capacité du test à détecter la présence de virus. L'amplification a lieu à travers une série de cycles – une copie devient deux, deux devient quatre, et ainsi de suite – et c'est après plusieurs cycles qu'une quantité détectable de virus est produite.

Abréviation de seuil de cycle, Ct est une valeur qui ressort lors des tests RT-PCR, l'étalon-or pour la détection du coronavirus SARS-CoV-2.

Selon l'avis de l'ICMR, la valeur Ct d'une réaction RT-PCR est le nombre de cycles auxquels la fluorescence du produit PCR est détectable au-delà du signal de fond. En termes simples, la valeur Ct fait référence au nombre de cycles après lesquels le virus peut être détecté. Si un nombre de cycles plus élevé est requis, cela implique que le virus n'a pas été détecté lorsque le nombre de cycles était inférieur. Plus la valeur Ct est faible, plus la charge virale est élevée, car le virus a été détecté après moins de cycles.

Également dans Expliqué |Augmentation des cas de Covid-19, croissance plus lente

Pourquoi la valeur CT est-elle importante ?

Pour mettre cela en contexte, examinons l'avis de l'ICMR et la lettre du Maharashtra à l'ICMR. Selon l'ICMR, un patient est considéré comme Covid-positif si la valeur Ct est inférieure à 35. En d'autres termes, si le virus est détectable après 35 cycles ou plus tôt, alors le patient est considéré comme positif. Si la référence devait être abaissée à 24 – la valeur mentionnée dans la lettre du Maharashtra – cela signifierait que les valeurs Ct comprises entre 25 et 34 ne seraient pas considérées comme positives. Une référence de 35 signifie donc que plus de patients seraient considérés comme positifs que nous n'en obtiendrions si la référence était de 24. L'ICMR a déclaré que l'abaissement du paramètre de seuil Ct peut entraîner la disparition de plusieurs personnes infectieuses.

Le meilleur des explications

Cliquez ici pour en savoir plus

On peut considérer la valeur Ct comme une mesure du potentiel de transmission, a déclaré le virologue Dr Shahid Jameel. “Donc, s'il y a plus de virus dans ma gorge et mon nez, je le transmettrai mieux”, a déclaré le Dr Jameel, directeur de la Trivedi School of Biosciences de l'Université d'Ashoka.

Selon l'ICMR, un patient est considéré comme Covid-positif si la valeur Ct est inférieure à 35.

Quelle est la signification du seuil ICMR de 35 ?

Globalement, le seuil accepté pour le Ct la valeur pour Covid-19 varie entre 35 et 40, selon les instructions des fabricants respectifs d'équipements de test. L'ICMR est arrivé à la valeur Ct de 35 sur la base des expériences de laboratoire et des contributions de plusieurs laboratoires de virologie.

Il n'y a pas eu de nouvel avis, mais l'ICMR a informé le gouvernement du Maharashtra qu'il n'était pas conseillé d'utiliser un paramètre de seuil de cycle inférieur car cela entraînerait la disparition de plusieurs personnes infectieuses et augmenterait la transmission de la maladie, a déclaré le Dr Balram Bhargava, DG de l'ICMR.

Existe-t-il une corrélation entre un Valeur Ct et gravité de la maladie ?

Non. Bien que la valeur Ct soit inversement corrélée à la charge virale, elle n'a aucune incidence sur la gravité de la maladie, ont déclaré les experts. Un patient peut avoir une valeur Ct faible, ce qui signifie que sa charge virale est suffisamment élevée pour être détectée rapidement, mais il peut toujours être asymptomatique.

Une petite étude publiée dans l'Indian Journal of Medical Microbiology en janvier 2021 a révélé qu'il n'y avait aucune corrélation entre les valeurs de Ct et la gravité de la maladie ou la mortalité chez les patients atteints de la maladie Covid-19. Il a constaté que le temps écoulé depuis l'apparition des symptômes a une relation plus forte avec les valeurs Ct par rapport à la gravité de la maladie.

La valeur Ct nous renseigne sur la charge virale dans la gorge et non dans les poumons, a déclaré le Dr Parikshit Prayag, consultant en maladies infectieuses à l'hôpital Deenanath Mangeshkar de Pune. “La valeur Ct n'est pas corrélée à la gravité – seulement à l'infectiosité. Dans le premier rapport, je ne regarde pas vraiment la valeur Ct, mais pour le suivi des patients à l'hôpital, je considère la valeur Ct, car je peux alors décider de transférer ou non le patient dans le bâtiment non Covid . Du point de vue de l'infectiosité, cela peut avoir de l'importance, pas la gravité », a déclaré le Dr Prayag.

Une valeur Ct élevée signifie-t-elle toujours une charge virale faible ?

Bien que cela puisse être la conclusion évidente, certains experts soulignent que certains patients peuvent avoir une valeur Ct élevée et pourtant avoir une niveau très important d'infection au Covid-19, et inversement. De nombreux facteurs sont importants dans l'interprétation d'un test RT-PCR, et les résultats peuvent également dépendre de la méthode de prélèvement des échantillons et du temps écoulé entre l'infection, le prélèvement et l'analyse.

LIRE AUSSI |Lutte contre le coronavirus, deux ans après

Un avis de l'ICMR en août 2020 a noté que les valeurs Ct dépendent de la manière dont l'échantillon a été collecté. Un échantillon mal collecté peut refléter des valeurs de Ct inappropriées. En outre, les valeurs Ct sont également déterminées par la compétence technique de la personne effectuant le test, l'étalonnage de l'équipement et les compétences analytiques des interprètes.

Encore une fois, les valeurs Ct peuvent différer entre les échantillons nasaux et oropharyngés prélevés sur le même individu. La température de transport, ainsi que le temps nécessaire entre la collecte et la réception au laboratoire, peuvent également avoir un impact négatif sur les valeurs Ct.

Cet article a été initialement publié le 28 avril 2021.

Newsletter | Cliquez pour obtenir les meilleurs explicateurs de la journée dans votre boîte de réception

📣 L'Indian Express est maintenant sur Telegram. Cliquez ici pour rejoindre notre chaîne (@indianexpress) et restez informé des derniers titres

Pour toutes les dernières actualités expliquées, téléchargez l'application Indian Express.

  • Le site Web d'Indian Express a été évalué VERT pour sa crédibilité et sa fiabilité par Newsguard, un service mondial qui évalue les sources d'information en fonction de leurs normes journalistiques.

© L'Indian Express (P ) Ltd