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Variante Omicron mutée de Covid-19 : douce et pourtant dangereuse

Les gens attendent dans la file d'attente pour être testés pour Covid-19 au milieu de la troisième vague, alimentée en grande partie par Omicron. (Photo d'archive)

La variante Omicron fortement muté bat des records de cas quotidiens, mais les hospitalisations et les décès sont moins par rapport aux pics atteints par Delta l'année dernière.

Les États-Unis et le monde a signalé un record de 5,85 lakh et de 18,95 lakh de nouvelles infections le 5 janvier (moyenne mobile sur 7 jours), soit une variation sur 14 jours de près de 250 % et 165 % respectivement. Mais le nombre respectif de décès ce jour-là était d'environ 1 300 et 6 100, en baisse d'environ 3 % et 9 % par rapport à il y a 14 jours.

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Omicron, isolé pour la première fois en Afrique du Sud le 24 novembre, présente 32 mutations sur la protéine de pointe. Avec plusieurs d'entre eux associés à une transmissibilité plus élevée et à une évasion immunitaire, Omicron a rapidement été déclaré variante préoccupante par l'Organisation mondiale de la santé (OMS). Cependant, alors que l'Afrique du Sud se préparait à un tsunami de patients malades, les hospitalisations ont chuté, même si les cas d'Omicron ont augmenté.

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Omicron est-il vraiment doux ?

Une étude d'Afrique du Sud publiée dans JAMA Network a rapporté que seulement 41,3 % des personnes séropositives pour le Covid se rendant aux urgences hospitalières ont dû être admises lors de la vague Omicron contre 68 à 69 % lors de la vague Delta. La proportion nécessitant une oxygénothérapie était de 17,6% dans l'onde Omicron, nettement inférieure aux 74% dans l'onde Delta.

Delta vs Omicron : Comment les variantes diffèrent

Une analyse d'un grand volume de données de la UK Health Security Agency publiée dans le BMJ a indiqué que les personnes infectées par Omicron avaient entre 50 et 70 ans % moins susceptibles d'être admis à l'hôpital que les personnes infectées par Delta.

« La gravité de la maladie avec Omicron semble être inférieure de 66 à 80 % sur la base des données du Royaume-Uni et de l'Afrique du Sud. L'expérience de l'Afrique du Sud donne également l'assurance qu'un pays comme l'Inde qui a déjà connu des niveaux élevés d'infections et dont la vaccination est comparable à celle des pays occidentaux avec très peu d'hésitation à la vaccination, s'en sortira probablement mieux », a déclaré le Dr Anurag Agrawal, expert en poumon maladie et directeur du CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, New Delhi.

« Cela, cependant », a-t-il averti, « ne signifie pas qu'Omicron est inoffensif ; les gens atterrissent toujours dans les unités de soins intensifs”.

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Quelle a été l'expérience de l'Inde jusqu'à présent ?

Même si les cas augmentent fortement – ​​l'Inde a signalé près de 91 000 nouveaux cas jeudi (24 heures précédentes) contre seulement 6 358 cas 10 jours plus tôt – les médecins de tout le pays affirment que presque tous les patients présentent des symptômes bénins : fièvre modérée, mal de gorge, maux de tête, courbatures et fatigue. Certains patients ont des diarrhées, des nausées et des étourdissements.

À l'AIIMS à New Delhi – où, a déclaré lundi le ministre de la Santé de Delhi, Satyendar Jain, 81% des échantillons séquencés étaient d'Omicron – aucun patient n'a développé de pneumonie due à Covid-19, et aucun n'a eu besoin d'oxygène ou d'un ventilateur uniquement pour l'infection à coronavirus . Les médecins ont également signalé que les symptômes se résolvent en environ quatre à cinq jours au plus, bien plus tôt que l'infection moyenne par Delta.

« Il y a 75 patients Covid-19 admis à l'hôpital ; cependant, presque tous sont admis soit parce qu'ils souffrent d'une autre affection nécessitant des soins hospitaliers, soit parce qu'il s'agit de membres du personnel qui n'avaient pas d'espace pour s'isoler à la maison. Il y a quelques personnes sous ventilateurs mais encore une fois, elles étaient déjà atteintes d'autres maladies lorsqu'elles ont contracté Covid-19 », Dr Anjan Trikha, chef du groupe de gestion clinique du centre de traumatologie AIIMS, qui est un centre de traitement dédié à Covid-19 , a déclaré mercredi à The Indian Express.

« Je n'ai pas vu un seul patient avec une pneumonie Covid-19 pure ou des poumons endommagés comme nous l'avons vu pendant la vague Delta (d'avril à mai 2021) », a-t-il déclaré. .

Il a déclaré qu'à l'exception de quelques cas, presque tous les patients admis à l'AIIMS ont reçu au moins une dose de vaccin, et la plupart sont complètement vaccinés.

Les médecins de Mumbai ont signalé une tendance similaire. Le Maharashtra compte le plus grand nombre de cas d'Omicron dans le pays – 797, selon les données publiées jeudi par le ministère de la Santé de l'Union.

« La plupart des hospitalisations sont initialement dues à d'autres conditions, et les patients sont ensuite testés positifs pour Covid-19 », a déclaré le Dr Lancelot Pinto, épidémiologiste et pneumologue à l'hôpital PD Hinduja de Mumbai.

«Ce sont les premiers jours, mais nous n'avons pas encore vu de cas graves. Il existe une très faible possibilité de baisse de la saturation en oxygène, car la variante Omicron affecte principalement les voies respiratoires supérieures », a déclaré le Dr Pinto.

Cela signifie-t-il que nous n'avons pas à nous soucier d'Omicron ?

Non. Omicron peut provoquer une maladie moins grave chez la plupart des individus, mais en raison de sa transmissibilité très élevée, les hôpitaux peuvent être inondés de personnes non immunisées, de personnes vivant avec des comorbidités ou de personnes dont le système immunitaire est affaibli.

Omicron est au moins 1,5 à 2 fois plus transmissible que Delta, ce qui a entraîné un très grand nombre d'infections dans le monde en très peu de temps. Il est également 2 à 3 fois plus capable que Delta d'infecter ceux qui ont été complètement vaccinés ou ceux qui ont déjà été infectés.

« Le risque de maladie grave est inférieur à Delta, mais c'est ne dit pas grand chose. Je ne suis pas préoccupé par Delhi ou Mumbai qui ont déjà vu d'énormes vagues Delta, et où les systèmes de santé sont assez robustes. Le problème surviendra lorsque Omicron se propagera dans des endroits où le système de santé est inégal et où il n'y a pas eu d'infections Delta », a déclaré le Dr Agrawal.

« De plus, dans la phase initiale d'une vague, les jeunes qui sont en déplacement sont plus susceptibles d'attraper l'infection, mais la maladie est également moins grave chez eux. Nous ne comprendrons le problème que lorsqu'il commencera à affecter les personnes âgées et vulnérables », a-t-il déclaré.

Le Dr GC Khilnani, ancien chef du service de pneumologie à l'AIIMS qui est maintenant chef des soins pulmonaires, des soins intensifs et de la médecine du sommeil à l'hôpital PSRI de New Delhi, a déclaré : « Si le dénominateur devient suffisamment grand, alors nous commencerons à voir une augmentation de hospitalisation. Il ciblera ceux qui n'ont pas été vaccinés, ceux qui n'ont pas eu l'infection ou ceux qui ont des comorbidités dans la communauté. »

En outre, la variante hautement infectieuse et immuno-évasive affecte les médecins et le personnel de santé – au moins 120 médecins ont été testés positifs à Delhi et isolent ou mettent en quarantaine dans quatre grands hôpitaux. Si les cas continuent d'augmenter fortement pendant une période prolongée, davantage de personnels de santé seront infectés et les hôpitaux pourraient connaître des pénuries de personnel.

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Qu'est-ce qui rend l'Omicron plus transmissible mais moins dangereux pour le patient ?

Au fil des Au cours du dernier mois, plusieurs grandes études de cultures cellulaires et de modèles animaux ont suggéré qu'Omicron est principalement une maladie des voies respiratoires supérieures – il préfère se répliquer dans les voies respiratoires supérieures plutôt que profondément dans les poumons, où les coronavirus causent les pires dommages.

Équipes distinctes à l'Université de Cambridge et à l'Université de Glasgow ont conclu que TMPRSS-2, une protéine présente dans de nombreuses cellules pulmonaires, qui est utilisée par les coronavirus pour l'entrée et la propagation du virus, n'a pas beaucoup d'affinité avec Omicron.

“En effet, nous avons montré que dans les cellules pulmonaires exprimant TMPRSS2, le virus Omicron vivant présentait une réplication significativement plus faible par rapport à Delta”, a déclaré l'étude de Cambridge, dirigée par le Dr Ravindra Gupta.

Mais le taux de réplication plus élevé du virus dans les voies respiratoires supérieures signifie également qu'il est plus facile de le transmettre à d'autres lorsqu'une personne infectée tousse, éternue ou parle. Les scientifiques étudient également des facteurs tels que si la variante est plus stable ou est mieux à même d'infecter de nouvelles personnes dans l'air.

Le Dr Agrawal a averti que bien qu'Omicron soit “moins susceptible d'infecter profondément les poumons, il le peut toujours” – et “ce n'est pas une simple infection des voies respiratoires supérieures”. Et cette distinction devient plus importante à mesure que le dénominateur augmente, a-t-il déclaré. “Omicron n'est pas un vaccin naturel sans risque.”

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