Des particules de SARS-CoV-2 (colorées en jaune) émergent de la surface d'une cellule cultivée en laboratoire. (NIAID)
Une nouvelle variante de Covid-19 avec plus de 30 mutations de pointe a été signalée en Afrique australe. Le 23 novembre, le Dr Tom Peacock, virologue à l'Imperial College de Londres, a publié les détails de la variante sur github.com, notant que “la quantité incroyablement élevée de mutations de pointes suggère que cela pourrait être une réelle préoccupation (évasion prévue de la plupart des anticorps monoclonaux) »
Attribué comme B.1.1.529, le variant a été repéré pour la première fois au Botswana et les autres pays en circulation sont Hong Kong et l'Afrique du Sud. Selon The Guardian, seuls 10 cas ont été confirmés par séquençage génomique.
Dr. Tom Peacock a tweeté que la variante devrait être surveillée en raison de son “profil de pointe horrible”.
Juste repéré : très petit groupe de variantes associées à l'Afrique australe avec une très longue longueur de branche et un profil de mutation Spike vraiment horrible, y compris RBD – K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505Hhttps://t.co/kgA9c1hKDa
— Tom Peacock (@PeacockFlu) 23 novembre 2021
Selon l'OMS, actuellement, seules quatre variantes du coronavirus sont désignées comme variantes préoccupantes – Alpha (lignée B.1.1.7, la soi-disant “variante britannique”), Beta (lignée B.1.351, la soi-disant “variante de l'Afrique du Sud”), Gamma (lignée P.1, la soi-disant “Brésil variant') et Delta (lignée B.1.617.2).
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“Cela vaut la peine de souligner qu'il s'agit actuellement d'un nombre très faible dans une région d'Afrique assez bien échantillonnée, cependant, cela devrait être très bien surveillé en raison de cet horrible profil de pointe (je suppose que ce serait pire antigéniquement que presque tout le reste),” a déclaré le Dr Peacock.
La mutation P681H observée dans la nouvelle variante a également été signalée dans les variantes Alpha, Mu, certaines variantes Gamma et B.1.1.318. La nouvelle variante porte également la mutation N679K qui a été signalée dans de nombreuses autres variantes. Le Dr Peacock tweete : “C'est la première fois que je vois deux de ces mutations dans une seule variante”
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La nouvelle variante porte également une mutation appelée N501Y qui a été signalée dans d'autres variantes préoccupantes. Des études ont montré que cette mutation aide le variant à être plus transmissible. Il permet également au virus de se lier facilement aux récepteurs de l'enzyme humaine de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2).
Il porte également la mutation P681H, l'une des mutations de pointe couramment identifiées dans le SRAS CoV-2, qui améliore la transmissibilité du virus. La mutation D614G qui a été signalée pour augmenter l'infectiosité du virus a également été observée dans la nouvelle variante.
Dr. Divya Tej Sowpati du CSIR-Centre de biologie cellulaire et moléculaire a déclaré que très peu de séquences génomiques de la nouvelle variante sont disponibles et que des études supplémentaires sont nécessaires. « La variante est actuellement surveillée », dit-il.
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